Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRG1Q02297 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms