Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFRSF17Q02223 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms