Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLCB3Q01970 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms