Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTUD4Q01804 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms