Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms