Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ELF3P78545 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELF3P78545 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELF3P78545 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELF3P78545 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELF3P78545 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELF3P78545 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELF3P78545 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELF3P78545 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELF3P78545 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELF3P78545 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELF3P78545 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ELF3P78545 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELF3P78545 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELF3P78545 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELF3P78545 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELF3P78545 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELF3P78545 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELF3P78545 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ELF3P78545 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELF3P78545 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELF3P78545 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELF3P78545 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELF3P78545 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELF3P78545 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ELF3P78545 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELF3P78545 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELF3P78545 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELF3P78545 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELF3P78545 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELF3P78545 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELF3P78545 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELF3P78545 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELF3P78545 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELF3P78545 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELF3P78545 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELF3P78545 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELF3P78545 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELF3P78545 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ELF3P78545 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELF3P78545 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELF3P78545 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELF3P78545 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELF3P78545 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELF3P78545 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELF3P78545 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELF3P78545 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELF3P78545 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELF3P78545 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELF3P78545 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELF3P78545 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELF3P78545 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELF3P78545 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELF3P78545 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELF3P78545 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ELF3P78545 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms