Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms