Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UFM1P61960 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UFM1P61960 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UFM1P61960 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UFM1P61960 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UFM1P61960 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UFM1P61960 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UFM1P61960 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UFM1P61960 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UFM1P61960 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UFM1P61960 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UFM1P61960 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UFM1P61960 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UFM1P61960 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UFM1P61960 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UFM1P61960 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UFM1P61960 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UFM1P61960 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UFM1P61960 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UFM1P61960 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UFM1P61960 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UFM1P61960 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UFM1P61960 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UFM1P61960 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UFM1P61960 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UFM1P61960 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFM1P61960 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms