Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms