Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GEMP55040 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GEMP55040 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GEMP55040 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GEMP55040 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GEMP55040 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GEMP55040 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GEMP55040 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GEMP55040 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GEMP55040 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GEMP55040 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GEMP55040 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GEMP55040 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GEMP55040 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GEMP55040 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GEMP55040 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GEMP55040 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GEMP55040 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEMP55040 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEMP55040 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEMP55040 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEMP55040 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GEMP55040 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEMP55040 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEMP55040 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEMP55040 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEMP55040 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEMP55040 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEMP55040 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEMP55040 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEMP55040 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GEMP55040 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEMP55040 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEMP55040 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEMP55040 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GEMP55040 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEMP55040 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GEMP55040 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEMP55040 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEMP55040 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEMP55040 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEMP55040 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GEMP55040 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEMP55040 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEMP55040 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GEMP55040 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEMP55040 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEMP55040 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEMP55040 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEMP55040 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEMP55040 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEMP55040 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEMP55040 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEMP55040 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEMP55040 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEMP55040 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEMP55040 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEMP55040 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GEMP55040 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEMP55040 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEMP55040 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEMP55040 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEMP55040 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEMP55040 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEMP55040 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEMP55040 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEMP55040 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEMP55040 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEMP55040 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEMP55040 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEMP55040 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEMP55040 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEMP55040 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEMP55040 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEMP55040 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEMP55040 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEMP55040 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEMP55040 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEMP55040 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GEMP55040 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEMP55040 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEMP55040 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEMP55040 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GEMP55040 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEMP55040 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEMP55040 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEMP55040 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEMP55040 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEMP55040 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEMP55040 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GEMP55040 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEMP55040 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEMP55040 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEMP55040 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEMP55040 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEMP55040 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEMP55040 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEMP55040 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEMP55040 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GEMP55040 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms