Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP4P49662 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP4P49662 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP4P49662 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP4P49662 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP4P49662 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP4P49662 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP4P49662 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP4P49662 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP4P49662 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP4P49662 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP4P49662 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP4P49662 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP4P49662 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP4P49662 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP4P49662 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP4P49662 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP4P49662 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP4P49662 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP4P49662 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP4P49662 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP4P49662 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP4P49662 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP4P49662 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP4P49662 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP4P49662 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP4P49662 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP4P49662 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP4P49662 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP4P49662 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP4P49662 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP4P49662 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP4P49662 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP4P49662 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP4P49662 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP4P49662 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP4P49662 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP4P49662 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP4P49662 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP4P49662 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP4P49662 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP4P49662 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP4P49662 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP4P49662 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP4P49662 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP4P49662 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP4P49662 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP4P49662 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP4P49662 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP4P49662 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP4P49662 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP4P49662 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP4P49662 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP4P49662 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP4P49662 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP4P49662 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP4P49662 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP4P49662 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP4P49662 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP4P49662 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP4P49662 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP4P49662 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP4P49662 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP4P49662 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP4P49662 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP4P49662 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP4P49662 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP4P49662 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP4P49662 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP4P49662 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP4P49662 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP4P49662 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP4P49662 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP4P49662 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP4P49662 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP4P49662 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP4P49662 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP4P49662 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP4P49662 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP4P49662 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP4P49662 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP4P49662 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP4P49662 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP4P49662 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP4P49662 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP4P49662 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP4P49662 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP4P49662 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP4P49662 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP4P49662 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP4P49662 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP4P49662 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP4P49662 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP4P49662 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP4P49662 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP4P49662 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP4P49662 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP4P49662 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP4P49662 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP4P49662 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms