Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTPAP49638 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTPAP49638 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTPAP49638 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTPAP49638 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTPAP49638 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTPAP49638 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTPAP49638 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTPAP49638 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTPAP49638 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTPAP49638 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTPAP49638 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTPAP49638 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTPAP49638 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTPAP49638 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTPAP49638 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTPAP49638 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTPAP49638 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTPAP49638 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTPAP49638 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTPAP49638 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTPAP49638 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTPAP49638 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTPAP49638 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTPAP49638 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTPAP49638 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTPAP49638 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTPAP49638 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTPAP49638 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTPAP49638 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTPAP49638 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTPAP49638 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTPAP49638 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTPAP49638 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTPAP49638 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTPAP49638 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTPAP49638 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTPAP49638 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTPAP49638 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTPAP49638 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTPAP49638 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTPAP49638 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTPAP49638 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTPAP49638 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTPAP49638 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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TTPAP49638 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTPAP49638 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTPAP49638 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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TTPAP49638 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTPAP49638 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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TTPAP49638 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTPAP49638 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTPAP49638 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTPAP49638 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTPAP49638 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTPAP49638 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTPAP49638 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTPAP49638 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTPAP49638 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTPAP49638 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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TTPAP49638 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTPAP49638 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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TTPAP49638 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTPAP49638 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTPAP49638 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTPAP49638 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTPAP49638 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTPAP49638 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TTPAP49638 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTPAP49638 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTPAP49638 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTPAP49638 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTPAP49638 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTPAP49638 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTPAP49638 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TTPAP49638 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TTPAP49638 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TTPAP49638 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTPAP49638 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTPAP49638 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTPAP49638 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTPAP49638 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTPAP49638 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTPAP49638 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTPAP49638 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TTPAP49638 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTPAP49638 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTPAP49638 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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