Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms