Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RANGAP1P46060 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms