Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACADSBP45954 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms