Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRATP43155 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRATP43155 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRATP43155 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRATP43155 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRATP43155 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRATP43155 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRATP43155 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRATP43155 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRATP43155 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRATP43155 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRATP43155 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRATP43155 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRATP43155 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRATP43155 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRATP43155 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRATP43155 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRATP43155 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRATP43155 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CRATP43155 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRATP43155 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CRATP43155 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRATP43155 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRATP43155 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRATP43155 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CRATP43155 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CRATP43155 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRATP43155 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRATP43155 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CRATP43155 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRATP43155 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRATP43155 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRATP43155 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRATP43155 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRATP43155 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRATP43155 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRATP43155 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRATP43155 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRATP43155 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRATP43155 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRATP43155 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRATP43155 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRATP43155 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRATP43155 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRATP43155 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRATP43155 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CRATP43155 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRATP43155 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRATP43155 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CRATP43155 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRATP43155 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRATP43155 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRATP43155 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRATP43155 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRATP43155 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRATP43155 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRATP43155 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRATP43155 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRATP43155 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRATP43155 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRATP43155 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRATP43155 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CRATP43155 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRATP43155 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CRATP43155 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRATP43155 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRATP43155 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRATP43155 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRATP43155 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRATP43155 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRATP43155 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRATP43155 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRATP43155 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRATP43155 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRATP43155 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRATP43155 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRATP43155 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRATP43155 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRATP43155 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRATP43155 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRATP43155 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRATP43155 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms