Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZEB1P37275 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms