Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN2P35609 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms