Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms