Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CNGA1P29973 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms