Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB3P28472 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRB3P28472 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms