Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms