Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO1P25800 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO1P25800 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO1P25800 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO1P25800 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO1P25800 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO1P25800 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO1P25800 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO1P25800 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO1P25800 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO1P25800 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO1P25800 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO1P25800 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO1P25800 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO1P25800 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO1P25800 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO1P25800 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO1P25800 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO1P25800 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO1P25800 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO1P25800 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO1P25800 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO1P25800 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO1P25800 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO1P25800 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO1P25800 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO1P25800 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO1P25800 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO1P25800 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO1P25800 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO1P25800 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO1P25800 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO1P25800 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO1P25800 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO1P25800 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO1P25800 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO1P25800 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO1P25800 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO1P25800 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO1P25800 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO1P25800 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO1P25800 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO1P25800 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO1P25800 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO1P25800 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO1P25800 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO1P25800 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO1P25800 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO1P25800 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO1P25800 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO1P25800 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO1P25800 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO1P25800 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO1P25800 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO1P25800 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO1P25800 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO1P25800 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO1P25800 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO1P25800 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO1P25800 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO1P25800 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO1P25800 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO1P25800 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO1P25800 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO1P25800 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO1P25800 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO1P25800 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO1P25800 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO1P25800 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO1P25800 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO1P25800 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO1P25800 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO1P25800 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO1P25800 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO1P25800 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO1P25800 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO1P25800 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO1P25800 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO1P25800 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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