Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5A1P25705 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms