Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCHP24723 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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