Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USF1P22415 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF1P22415 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF1P22415 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF1P22415 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF1P22415 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF1P22415 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF1P22415 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF1P22415 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF1P22415 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF1P22415 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF1P22415 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF1P22415 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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