Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP4AP20648 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms