Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms