Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms