Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS1P17812 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms