Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXD8P13378 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms