Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TPRP12270 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TPRP12270 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TPRP12270 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TPRP12270 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TPRP12270 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TPRP12270 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TPRP12270 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TPRP12270 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TPRP12270 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TPRP12270 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TPRP12270 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TPRP12270 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TPRP12270 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TPRP12270 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TPRP12270 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TPRP12270 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TPRP12270 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TPRP12270 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TPRP12270 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TPRP12270 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TPRP12270 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TPRP12270 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TPRP12270 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TPRP12270 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TPRP12270 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TPRP12270 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TPRP12270 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TPRP12270 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TPRP12270 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRP12270 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRP12270 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRP12270 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TPRP12270 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRP12270 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TPRP12270 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TPRP12270 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRP12270 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRP12270 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TPRP12270 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRP12270 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRP12270 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TPRP12270 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TPRP12270 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TPRP12270 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TPRP12270 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TPRP12270 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TPRP12270 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TPRP12270 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TPRP12270 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRP12270 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRP12270 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TPRP12270 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TPRP12270 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRP12270 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRP12270 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRP12270 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TPRP12270 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRP12270 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TPRP12270 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRP12270 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TPRP12270 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TPRP12270 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRP12270 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRP12270 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRP12270 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRP12270 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRP12270 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TPRP12270 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TPRP12270 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TPRP12270 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TPRP12270 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRP12270 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TPRP12270 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRP12270 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TPRP12270 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TPRP12270 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TPRP12270 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TPRP12270 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TPRP12270 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TPRP12270 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TPRP12270 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TPRP12270 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TPRP12270 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TPRP12270 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TPRP12270 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TPRP12270 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TPRP12270 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TPRP12270 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TPRP12270 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TPRP12270 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TPRP12270 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TPRP12270 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TPRP12270 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TPRP12270 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TPRP12270 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TPRP12270 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TPRP12270 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TPRP12270 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TPRP12270 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms