Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms