Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM10L2BP0DMW5 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms