Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APODP05090 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APODP05090 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APODP05090 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APODP05090 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APODP05090 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APODP05090 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APODP05090 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APODP05090 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APODP05090 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APODP05090 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APODP05090 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APODP05090 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APODP05090 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
APODP05090 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APODP05090 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APODP05090 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APODP05090 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APODP05090 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APODP05090 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APODP05090 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APODP05090 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APODP05090 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
APODP05090 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APODP05090 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APODP05090 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APODP05090 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
APODP05090 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APODP05090 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APODP05090 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APODP05090 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APODP05090 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APODP05090 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APODP05090 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APODP05090 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APODP05090 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APODP05090 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APODP05090 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APODP05090 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APODP05090 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APODP05090 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APODP05090 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APODP05090 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APODP05090 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APODP05090 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APODP05090 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APODP05090 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APODP05090 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APODP05090 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APODP05090 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APODP05090 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APODP05090 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APODP05090 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APODP05090 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APODP05090 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APODP05090 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APODP05090 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APODP05090 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APODP05090 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APODP05090 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APODP05090 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APODP05090 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APODP05090 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APODP05090 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APODP05090 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APODP05090 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APODP05090 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APODP05090 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APODP05090 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APODP05090 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APODP05090 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APODP05090 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APODP05090 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APODP05090 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APODP05090 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APODP05090 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APODP05090 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APODP05090 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APODP05090 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APODP05090 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APODP05090 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APODP05090 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APODP05090 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APODP05090 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APODP05090 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APODP05090 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APODP05090 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APODP05090 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms