Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNSO60931 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNSO60931 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNSO60931 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNSO60931 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNSO60931 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNSO60931 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNSO60931 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNSO60931 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNSO60931 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNSO60931 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNSO60931 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNSO60931 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNSO60931 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNSO60931 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNSO60931 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNSO60931 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNSO60931 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNSO60931 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNSO60931 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNSO60931 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNSO60931 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNSO60931 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNSO60931 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNSO60931 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNSO60931 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNSO60931 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNSO60931 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNSO60931 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNSO60931 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNSO60931 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNSO60931 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNSO60931 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNSO60931 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNSO60931 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNSO60931 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNSO60931 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNSO60931 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNSO60931 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNSO60931 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNSO60931 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNSO60931 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNSO60931 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNSO60931 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNSO60931 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNSO60931 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNSO60931 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNSO60931 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNSO60931 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNSO60931 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNSO60931 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNSO60931 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNSO60931 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNSO60931 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNSO60931 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNSO60931 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNSO60931 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNSO60931 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNSO60931 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNSO60931 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNSO60931 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNSO60931 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNSO60931 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNSO60931 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNSO60931 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNSO60931 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNSO60931 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNSO60931 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNSO60931 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNSO60931 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNSO60931 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNSO60931 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNSO60931 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNSO60931 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNSO60931 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNSO60931 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNSO60931 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNSO60931 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNSO60931 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNSO60931 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNSO60931 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNSO60931 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNSO60931 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNSO60931 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNSO60931 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNSO60931 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNSO60931 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNSO60931 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNSO60931 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNSO60931 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNSO60931 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNSO60931 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNSO60931 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNSO60931 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNSO60931 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNSO60931 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNSO60931 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNSO60931 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNSO60931 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTNSO60931 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms