Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF10O60809 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms