Protein–RNA interactions for Protein: O60260

PRKN, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKNO60260 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRKNO60260 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKNO60260 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKNO60260 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKNO60260 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRKNO60260 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKNO60260 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKNO60260 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRKNO60260 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKNO60260 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRKNO60260 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKNO60260 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKNO60260 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKNO60260 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKNO60260 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKNO60260 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKNO60260 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKNO60260 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKNO60260 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKNO60260 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKNO60260 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKNO60260 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKNO60260 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKNO60260 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKNO60260 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKNO60260 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKNO60260 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRKNO60260 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRKNO60260 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PRKNO60260 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRKNO60260 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PRKNO60260 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRKNO60260 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRKNO60260 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRKNO60260 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PRKNO60260 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRKNO60260 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRKNO60260 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRKNO60260 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRKNO60260 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRKNO60260 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRKNO60260 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRKNO60260 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRKNO60260 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
PRKNO60260 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRKNO60260 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PRKNO60260 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PRKNO60260 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
PRKNO60260 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRKNO60260 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms