Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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