Protein–RNA interactions for Protein: O15535

ZSCAN9, Zinc finger and SCAN domain-containing protein 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSCAN9O15535 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZSCAN9O15535 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZSCAN9O15535 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZSCAN9O15535 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms