Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCKDKO14874 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms