Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F3O00716 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F3O00716 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F3O00716 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F3O00716 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F3O00716 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F3O00716 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F3O00716 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F3O00716 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F3O00716 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F3O00716 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F3O00716 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F3O00716 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F3O00716 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F3O00716 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F3O00716 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F3O00716 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F3O00716 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F3O00716 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F3O00716 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F3O00716 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F3O00716 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F3O00716 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F3O00716 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F3O00716 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F3O00716 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F3O00716 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F3O00716 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F3O00716 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F3O00716 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F3O00716 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F3O00716 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F3O00716 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F3O00716 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F3O00716 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F3O00716 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F3O00716 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F3O00716 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F3O00716 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F3O00716 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F3O00716 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F3O00716 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F3O00716 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F3O00716 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F3O00716 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F3O00716 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F3O00716 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F3O00716 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F3O00716 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F3O00716 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F3O00716 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F3O00716 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F3O00716 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F3O00716 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F3O00716 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F3O00716 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F3O00716 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F3O00716 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F3O00716 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F3O00716 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F3O00716 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F3O00716 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F3O00716 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F3O00716 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F3O00716 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F3O00716 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F3O00716 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F3O00716 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F3O00716 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F3O00716 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F3O00716 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F3O00716 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F3O00716 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F3O00716 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F3O00716 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F3O00716 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F3O00716 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F3O00716 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F3O00716 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F3O00716 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F3O00716 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F3O00716 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F3O00716 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F3O00716 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F3O00716 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F3O00716 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F3O00716 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F3O00716 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F3O00716 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F3O00716 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F3O00716 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms