Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E9PBE3 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E9PBE3 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E9PBE3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E9PBE3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E9PBE3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E9PBE3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E9PBE3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E9PBE3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E9PBE3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E9PBE3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
E9PBE3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E9PBE3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
E9PBE3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E9PBE3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
E9PBE3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E9PBE3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
E9PBE3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E9PBE3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E9PBE3 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E9PBE3 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E9PBE3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E9PBE3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
E9PBE3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
E9PBE3 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E9PBE3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E9PBE3 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E9PBE3 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E9PBE3 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E9PBE3 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E9PBE3 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E9PBE3 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E9PBE3 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E9PBE3 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E9PBE3 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E9PBE3 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E9PBE3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E9PBE3 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
E9PBE3 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E9PBE3 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
E9PBE3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E9PBE3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E9PBE3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E9PBE3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E9PBE3 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E9PBE3 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E9PBE3 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
E9PBE3 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E9PBE3 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E9PBE3 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E9PBE3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E9PBE3 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E9PBE3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E9PBE3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E9PBE3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E9PBE3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E9PBE3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
E9PBE3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E9PBE3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E9PBE3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E9PBE3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E9PBE3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E9PBE3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E9PBE3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
E9PBE3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E9PBE3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
E9PBE3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E9PBE3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E9PBE3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E9PBE3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E9PBE3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E9PBE3 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E9PBE3 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E9PBE3 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E9PBE3 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E9PBE3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E9PBE3 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E9PBE3 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E9PBE3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E9PBE3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E9PBE3 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E9PBE3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E9PBE3 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E9PBE3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E9PBE3 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E9PBE3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E9PBE3 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E9PBE3 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E9PBE3 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E9PBE3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E9PBE3 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E9PBE3 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E9PBE3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E9PBE3 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E9PBE3 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E9PBE3 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E9PBE3 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E9PBE3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E9PBE3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E9PBE3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms