Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms