Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRRM4A7MD48 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRRM4A7MD48 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRRM4A7MD48 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRRM4A7MD48 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRRM4A7MD48 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SRRM4A7MD48 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRRM4A7MD48 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRRM4A7MD48 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRRM4A7MD48 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRRM4A7MD48 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRRM4A7MD48 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SRRM4A7MD48 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRRM4A7MD48 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRRM4A7MD48 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRRM4A7MD48 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRRM4A7MD48 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRRM4A7MD48 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SRRM4A7MD48 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRRM4A7MD48 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRRM4A7MD48 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SRRM4A7MD48 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRRM4A7MD48 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRRM4A7MD48 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRRM4A7MD48 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRRM4A7MD48 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRRM4A7MD48 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRRM4A7MD48 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRRM4A7MD48 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRRM4A7MD48 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRRM4A7MD48 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SRRM4A7MD48 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRRM4A7MD48 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRRM4A7MD48 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRRM4A7MD48 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRRM4A7MD48 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRRM4A7MD48 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRRM4A7MD48 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRRM4A7MD48 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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