Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms