Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC160A6NGH7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms