Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIPSLA2A3N6 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms