Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms