Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AFG3L2Q9Y4W6 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms